Istnienie dwóch europejskich infrastruktur danych geologicznych – EGDI i EPOS – może być mylące. Jednak różnią się one funkcjonalnością, rodzajem danych i służą różnym grupom użytkowników.

• EGDI zawiera przede wszystkim dane geologiczne o szerokim zakresie tematycznym (geologia podstawowa, zasoby mineralne, geoenergetyka, wody gruntowe, geochemia, geozagrożenia, geologia miejska itp.). W wielu przypadkach są to zharmonizowane, ogólnoeuropejskie zbiory danych. EGDI zawiera również raporty i inne dokumenty związane z projektami geologicznymi.
• EPOS zapewnia dostęp do infrastruktury badawczej w zakresie nauk o Ziemi, np.: obserwatoriów sejsmologicznych i wulkanologicznych, dotyczących płytkich uskoków, danych GNSS i satelitarnych, a także obserwacji geomagnetycznych i laboratoriów wieloskalowych. Ograniczona liczba warstw danych z EGDI jest również dostępna w EPOS, w tym mapa geologiczna powierzchniowa, informacje o odwiertach, kopalniach i modelach geologicznych 3D.